茎干区别：草麻黄关节的长度为3到4厘米；木贼的茎干圆筒状 ， 呈黑棕色，可达1米 。叶子区别：黄马草叶子两裂，先端尖锐；木贼的叶子呈鳞片状，基部呈筒状鞘 。花朵区别：草麻黄的花朵呈卵圆状；木贼不开花，会通过孢子繁殖 。
一、茎干区别
草麻黄的木质茎短有的呈匍匐状，小的枝干直伸或是微曲，表面有细纵的槽纹 ， 关节间的长度在2.5到5.5厘米，大多为3到4厘米 ， 直径大约2毫米，呈绿色 。

木贼的茎干横走或是直立的，圆筒状，呈黑棕色，高度可达1米或者更多，直径在5到9毫米之间，关节的长度大约5到8厘米，呈绿色 。

二、叶子区别
草麻黄的叶子有两裂，叶子鞘占全长的1/3或2/3，裂片的锐呈三角形，先端很尖锐 。

木贼的叶子退化成鳞片状 ， 基部合成筒状的鞘，鞘长大约6到10毫米 。

三、花朵区别
草麻黄的花朵在侧枝顶生，呈卵圆状或矩圆状卵圆形 ， 有4对苞片 。花朵成熟时呈肉质红色，矩圆状卵圆形或是接近圆形性，长度大约8毫米，直径大约6毫米 。
【草麻黄和木贼的区别】木贼不开花，会通过孢子繁殖 。

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